顧問料が高いのか安いのか、比べたことがありますか。

医院の顧問料は、年間で百万円前後になることが少なくありません。 10年で1,000万円です。それなりの買い物です。

なのに「いくらで、どこまでやってもらえるのか」を知らないまま払い続けている先生が、本当に多い。 相場と、その決まり方を書きます。うちの金額も出します。

この記事の結論

相場はいくらですか。
一般の中小企業なら顧問料が月2〜5万円、決算料が10〜30万円。年間で20〜80万円あたりが中心です。医療法人はもう少し上がって、年50〜100万円くらいが多い印象です。
何で金額が変わるのですか。
大きく3つ。①訪問の回数 ②帳簿を誰がつけるか ③頼む業務の範囲です。規模よりも、この3つで決まります。だからこの3つを動かせば、顧問料は下げられます。
安ければいいのですか。
いいえ。安い事務所は、安くできる理由があります。訪問しない、担当が税理士ではない、業務の範囲が狭い。それで納得できるなら正解です。知らずに安いほうを選ぶのが、いちばん危ない。

相場の目安

 一般の中小企業医療法人
顧問料(月)2〜5万円3〜10万円
決算料(年1回)10〜30万円15〜30万円
年間の合計20〜80万円50〜100万円

ずいぶん幅があります。これが実態です。 同じ規模の医院でも、2倍以上ちがうことがあります。

なお個人でクリニックをやっている場合は、これより下がります。 そもそも税理士が要るかどうかから考えていい段階です。 くわしくは税理士をつけるタイミングに書きました。

医療法人だと、なぜ上がるのか

医療法人は、株式会社よりやることが多いのです。

 株式会社にはないもの
事業報告書等の届出。会計年度が終わって3か月以内に、都道府県へ
資産の総額の変更登記。事業年度の末日から3か月以内に、毎年
社員総会・理事会の議事録
保険診療と自費を分けた消費税の計算
社会保険診療分を除いた事業税の計算

①と②は、税務署とは関係のない手続きです。 期限は決算から3か月。放っておくと毎年たまります。

④と⑤は、保険診療が消費税も事業税も対象外だから起きる、医療だけの計算です。 事業税消費税の記事もあわせてご覧ください。

金額を決めている3つのこと

 何で決まるか影響
訪問の回数毎月/3か月に1回/年1回で、大きく変わります
帳簿を誰がつけるか医院でつけるか、事務所に丸投げか
頼む業務の範囲給与計算・年末調整・届出まで入るか

売上の規模も見られますが、いちばん効くのは①の訪問回数です。

税理士事務所の原価は、ほぼ人件費です。 毎月行けば、移動と打ち合わせで半日は使います。 それが年12回。この時間の分が、そのまま金額に乗っています。

顧問料を下げる3つの方法

税理士の側から、正直に書きます。この3つで下がります。

 やること目安
訪問の回数を減らす。毎月 → 3か月に1回月5万円 → 3万円くらい
帳簿を医院でつける。クラウド会計を使う入力の手間の分だけ下がります
決算だけ頼む。顧問契約をやめるいちばん安い。ただし相談はできません

①は、言えば応じてもらえることが多いです。事務所の稼働が減るからです。 「毎月来てもらっているが、正直そこまで話すことがない」という医院なら、交渉の余地があります。

②は、いまはクラウド会計があるので現実的になりました。 領収書の写真を撮って、通帳を連携する。それだけで入力がかなり減ります。

③は、おすすめしません。 相談できないと、決算の3か月前に打てる手がなくなります。 決算3か月前にできることは、意外と多いのです。

下げるより、中身を増やすほうが得なことも

同じ金額で、いまやってもらっていないことを頼めないか聞いてみてください。 月次の業績報告、資金繰りの見通し、銀行への説明資料。
払っている金額は同じでも、受け取るものが増えれば、実質的に安くなります。

含まれていないものを、確かめてください

「顧問料に入っていると思っていた」——これが、いちばん多いもめごとです。

別料金になりやすいもの
年末調整
法定調書・給与支払報告書
償却資産税の申告
消費税の申告
理事長個人の確定申告
給与計算
事業報告書等の届出・資産総額の変更登記
税務調査の立ち会い
銀行に出す資料の作成

この一覧を持って、顧問契約書を見てください。 どれが入っていて、どれが別料金で、いくらなのか。 書いていなければ、聞いて書き足してもらう。

くわしくは顧問契約書のどこを見るかに書きました。

うちの金額も書いておきます

比べていただくために、当事務所の金額を出します。

 金額(税別)
顧問料月60,000円
決算料200,000円(年1回)
消費税の申告60,000円(年1回・課税事業者の場合のみ)
年間の合計980,000円

医業収入1億円以下・分院なしの医療法人の金額です。 クラウド会計の利用料(年35,760円〜・税別)は含まれません。

相場の上のほうです。安くはありません。 そのかわり、担当は代表税理士がそのまま務めます。スタッフに引き継ぎません。 医療法人の届出も登記の段取りも、銀行への説明資料も、この中に入っています。

最後に、いちばん言いたいことを。 顧問料は、高い安いではなく「見合っているか」で判断してください。

年98万円払って、税金が200万円変わるなら安い。 年40万円払って、帳簿を作るだけで相談に乗ってもらえないなら高い。 金額だけを比べても、答えは出ません。 いま何をしてもらっているかを、一度書き出してみてください。

出典:顧問料の相場に関する記述は、公的な統計に基づくものではなく、 筆者が実務で見聞きしている範囲での目安です。 医療法人の事業報告書等の届出は医療法第52条第1項(毎会計年度終了後3月以内)。 資産の総額の変更登記は組合等登記令第3条第3項(毎事業年度末日から3月以内)。 消費税の非課税は消費税法別表第二第6号。事業税の取扱いは地方税法第72条の23第2項。 当事務所の料金は2026年9月時点のもので、医業収入1億円以下・分院なしの医療法人の場合です。

いまの顧問料が見合っているか、一緒に見ます。

顧問契約書と、直近の決算書。この2つがあれば、 いくら払って、何をしてもらっているかを一覧にできます。 そのうえで、下げられるところと、増やしたほうがいいところをお伝えします。 乗り換えの営業はしません。いまの事務所で交渉する材料としてお使いください。

無料相談を申し込む
LINE

9つの質問で、先生の医院で「できそうな節税」だけを選び出します。

LINEにご登録いただいた先生に、限定ページ「医療法人の節税チェックリスト(84項目)」をお送りしています。

9つの質問に答えるだけ(約2分)で、84項目の中から先生の医院でできそうなものだけが残る「かんたん診断」付き。

結果からそのまま解説記事に飛べて、チェックした内容はスマホに残ります。

LINEで、節税チェックリスト84項目を受け取る

※ こちらから営業のご連絡をすることはありません。


※ 決算書などの資料は、セキュリティのためLINEではお送りにならないでください。

個別のご相談はお問い合わせフォームからお願いします。

最終更新:2026年9月12日

この記事について
本記事は一般的な情報提供を目的としたものであり、個別の税務判断を保証するものではありません。記載の制度・取扱いは執筆時点(2026年9月)のものであり、その後の制度改正等により変更される場合があります。加入資格の可否は個別の事情によって異なりますので、実際のご判断にあたっては、必ず中小機構および税理士等の専門家にご確認ください。
税理士・行政書士 山下久幸

税理士・行政書士山下 久幸

福岡で税理士事務所を営む。医療法人の設立・税務と、資産形成・相続サポートを専門とする。

税理士と行政書士の資格を一人で保有し、法人化の判断から認可申請、設立後の顧問、相続の設計までを一貫して担当している。